Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB3P54753 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms