Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAD23BP54727 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAD23BP54727 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAD23BP54727 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD23BP54727 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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