Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIP1P50238 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms