Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms