Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PRKCHP24723 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms