Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGA6P23229 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms