Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK11BP21127 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms