Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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PTPRAP18433 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRAP18433 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PTPRAP18433 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PTPRAP18433 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRAP18433 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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