Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CTLA4P16410 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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