Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VAV1P15498 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms