Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC073911.2-201ENST00000624989 468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 CASC20-201ENST00000415932 1484 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ID2-AS1-207ENST00000455965 794 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HOXB1P14653 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms