Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC5A1P13866 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms