Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNT1P13805 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms