Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRFP10586 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRFP10586 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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