Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DENRO43583 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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DENRO43583 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DENRO43583 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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