Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD6O43541 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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