Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSI1O43347 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSI1O43347 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms