Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CCRL2O00421 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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