Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
J3QRK9 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
J3QRK9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
J3QRK9 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
J3QRK9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms