Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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