Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-2B6SEH9 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms