Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms