Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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