Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms