Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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