Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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