Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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