Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTRT3Q9BYD9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTRT3Q9BYD9 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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