Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCD2Q9BXW9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCD2Q9BXW9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms