Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TDRD1Q9BXT4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms