Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COL25A1Q9BXS0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COL25A1Q9BXS0 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms