Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSSK1BQ9BXA7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms