Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLVAPQ9BX97 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms