Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
UPK3BQ9BT76 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms