Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms