Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms