Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HINFPQ9BQA5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HINFPQ9BQA5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms