Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
KCNS3Q9BQ31 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms