Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
LYSTQ99698 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms