Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPS6KC1Q96S38 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms