Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCNAQ96QF7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms