Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHMP4CQ96CF2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHMP4CQ96CF2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms