Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BHMTQ93088 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms