Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG4Q92954 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms