Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF548Q8NEK5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF548Q8NEK5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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