Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC50Q8IVM0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms