Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HECW1Q76N89 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECW1Q76N89 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms