Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms