Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms