Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CDO1Q16878 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CDO1Q16878 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDO1Q16878 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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